Le Drugeon est une rivière de moyenne montagne, affluent du Doubs, d’une longueur de 39 km. Il prend sa source dans les marais de Malpas et de Vaux-et-Chantegrue, à 930 m d’altitude dans la Combe du Sauvage. Son bassin versant s’étend sur 170 km2 et est composé d’une trentaine d’habitats naturels différents : pelouses sèches, bas-marais alcalins, prairies marécageuses, roselières, tourbières hautes, boisements, mares, lacs, etc. La présence de dépôts morainiques permet l’existence de nombreuses zones humides et de milieux tourbeux de très grande valeur écologique.
Le site abrite une importante population d’espèces végétales protégées telles que la saxifrage œil de bouc, le liparis de loesel ou l’hypne brillante. La faune y est également remarquable avec 145 espèces de vertébrés protégés et 9 espèces d’invertébrés. Vous rencontrerez sur ViaCluny.fr des espèces menacées d’oiseaux d’eau comme le râle des genêts, la marouette ponctuée et la bécassine des marais. Deux belvédères dont un avec vue sur le Drugeon et un observatoire ornithologique ont été installés. D’autres aménagements pédagogiques sont présents, en particulier sur le site des tourbières de Frasne.