La naissance du village est due à l’initiative d’Henri, seigneur de Joux : au 12ème siècle, ce dernier fit appel à des colons étrangers, des « Allemands », venus probablement de Suisse alémanique pour peupler une terre appartenant à l’abbaye de Montbenoit. L’abbaye engage alors un procès et obtient en 1337 du sire de Joux la rétrocession des terres avec leurs habitants : comme ce sont « des Allemands et gens étrangers, précise l’abbé, nous les avons habergés de nouveau à la coutume et à la manière de nos gens du Saugeois », mais en leur accordant toutefois le privilège d’être affranchis de la mainmorte et d’user de leur coutume particulière pour la transmission des héritages.
Après la déclaration de guerre à l’Allemagne en 1914, les habitants manifestèrent le désir de changer le nom de leur village. Ils eurent à se prononcer entre Sainte-Foy, Bellerive ou les Alliés : ce dernier ayant été retenu à la suite d’un vote, le changement de dénomination est demandé par le conseil municipal dans sa séance du 6 décembre 1914. Le village fait partie de la République du Saugeais, micronation autoproclamée par laquelle passe ViaCluny.fr et composée de onze communes situées dans le Haut-Doubs