L’itinéraire thématique Via Cluny est porté par des GR® et GRP® du territoire Bourgogne- Franche-Comté : GR®145 et GR®5 (Haut Doubs), GRP® Champagnole Nozeroy Jura, GR®59 (Jura), GRP® Tour du Clunisois, GR® 76 (Saône-et-Loire).
Les comités départementaux de la Fédération Française de Randonnée du Doubs, du Jura et de Saône-et-Loire sont représentés en Assemblée Générale de l’association Chemin de Cluny Bourgogne Franche-Comté.