Les lacs de Saint-Point et de Remoray occupent le fond d’une large vallée glaciaire. Ils ne formaient auparavant qu’un seul lac mais ils ont été séparés par l’accumulation des sédiments du Doubs qui forme un delta entre les deux lacs : vous aurez l’occasion de les longer sur vos randonnées ViaCluny.fr.
Le lac de Remoray constitue une réserve naturelle nationale avec 426 hectares de lac, marais, tourbière, rivière, prairie, forêt, gravière… à une altitude comprise entre 850 et 980 mètres. La faune et la flore y sont exceptionnelles ; une Maison de la Réserve permet aux visiteurs de comprendre ce milieu. Le lac s’appelait autrefois lac Savoureux et appartenait jusqu’à la Révolution à l’abbaye cistercienne du Mont-Sainte-Marie dont on peut voir les ruines vers le pont sur le Doubs.
Le lac de Saint-Point est le troisième lac naturel de France par sa superficie : situé à 849 mètres d’altitude, il mesure environ 7 km de long et, en moyenne, 800 mètres de large.
Les abords du lac ont été défrichés au début du 12ème siècle. Le lac s’appelle alors Lay Damvauthier, littéralement « lac de saint Vauthier », du nom d’un ermite qui aurait vécu à l’emplacement du village actuel de Saint-Point avec son acolyte Fournier. Des moines de l’abbaye de Romainmôtier établirent un prieuré clunisien en ce lieu et un village éponyme se bâtit autour du prieuré, jusqu’à ce que la renommée des reliques de saint Point, présentes dans l’église du prieuré, ne fasse changer de nom le village et le lac.
Le lac est fréquenté par les touristes et les pêcheurs, le poisson devenu emblématique du lac, le corégone, ayant été introduit en 1948 du lac de Neuchâtel où il était appelé « palée » : il reprit son nom scientifique en passant la frontière. Actuellement les espèces majoritaires peuplant les eaux du lac sont le corégone, la perche, le gardon, le brochet, la tanche et le rotengle. Le lac constitue aussi une réserve d’eau potable pour tous les villages riverains : Saint-Point-Lac, les Grangettes, Montperreux et Châon, Chaudron, le Vezenay et Malbuisson.